Documentação dos Usuários do GridUnesp
- Apresentação
- Política de Uso
- Cadastro
- Segurança
- Histórico
- Infraestrutura
- Manual do Usuário
- Acessando o Cluster
- Transferindo Arquivos
- Instalando Aplicações
- Processando Simulações
- Melhorando o Script de Submissão
- Política de Prioridade
- Otimizando o Desempenho
- Memória Compartilhada
- Memória Distribuída
- Job Array
- Aplicações instaladas
- Bibliotecas, compiladores e linguagens
- Amber
- Anaconda
- Beast
- Bowtie2
- Charmm
- ClustalW
- CP2K
- Crystal
- DFTB+
- Dirac
- ESPResSo
- ExaBayes
- Exciting
- fastStructure
- Foam-Extend
- g_mmpbsa
- Gamess
- Gamit
- Gaussian
- Gromacs
- Hmmer
- Lammps
- Mathematica
- Mopac
- Namd
- NetCDF
- OpenFoam
- Orca
- PartitionFinder
- PFinderUCE-SWSC-EN
- Phyluce
- Quantum-Espresso
- quest-qmc
- R
- RAxML
- RAxML-NG
- RNXCMP
- ROOT - Data Analisys Techniques
- RSEM
- Salmon
- Siesta
- Stacks
- Structure
- SU2
- SWAN
- Tesseract
- Trinity
- Weka
- Boas Práticas
- Estatísticas
- Publicações
- Pesquisa de Satisfação
- Perguntas Frequentes
- Acesso ao GridUnesp
- 1) Como obter ajuda para utilizar o GridUnesp?
- 2) Como faço login no GridUnesp?
- 3) Não lembro minha senha. Como faço para resetar?
- 4) Ao tentar fazer login no GridUnesp, aparece “The authenticity of host ‘access2.grid.unesp.br (200.145.46.48)’ can’t be established”. O que isso significa?
- 5) Ao tentar fazer login no GridUnesp, aparece “WARNING: POSSIBLE DNS SPOOFING DETECTED!”? O que isso significa?
- 6) Por que não consigo fazer login?
- 7) Estava conectado no GridUnesp e de repente o terminal travou. Por quê?
- 8) Não sei o que fazer depois de acessar minha conta no GridUnesp. Pode me ajudar?
- 9) É possível acessar o GridUnesp via browser?
- Transferência de arquivos
- Instalação de programas, softwares e bibliotecas
- Processamento de simulações
- Monitoramento dos Jobs
- 17) Por quanto tempo meu job pode ficar processando no GridUnesp?
- 18) Há quantas filas/particões no GridUnesp?
- 19) Como sei que meu job começou a processar?
- 20) Por que meu job está demorando tanto para começar a processar?
- 21) Existe alguma previsão de quando meu job vai começar a processar?
- 22) Por que meus jobs não começaram a processar enquanto outros usuários tem tantos jobs em execução?
- Falhas no processamentos
- Optimização das simulações
- 27) O que faço para o processamento do meu job ficar mais rápido?
- 28) Quantas CPUs/threads posso solicitar para o meu job?
- 29) Tem GPU no GridUnesp?
- 30) Como faço para processar simulações com várias CPUs?
- 31) Como faço para processar jobs em paralelo?
- 32) Como faço para usar ferramentas MPI?
- 33) Como configurar determinada quantidade de nós de processamento?
- 34) É possível enviar vários jobs de uma vez com um único comando sbatch?
- 35) Por que o processamento do meu job é mais rápido quando uso um único nó do que quando uso vários?
- 36) O GridUnesp utiliza rede InfiniBand ou Ethernet?
- Boas práticas de uso
- 37) Minha simulações têm arquivos muito grandes? Tem algum problema?
- 38) Como faço para usar o /store/ em vez do /tmp/?
- 39) Como faço para usar o /tmp/ em vez do /store/?
- 40) Posso deixar meus arquivos guardados no GridUnesp?
- 41) Como faço para apagar arquivos da minha conta?
- 42) Tem algo que eu possa fazer para contribuir para manter o GridUnesp em bom funcionamento?
- Outros tipos de dúvidas
- 43) O GridUnesp usa Ubuntu?
- 44) Qual é o sistema operacional do GridUnesp? Linux ou Windows?
- 45) É possível usar programs interativos no GridUnesp?
- 46) Como abrir aplicações visuais no GridUnesp?
- 47) Está difícil resolver o problema com minha simulação. Seria possível ter uma conversa por vídeo conferência?
- Acesso ao GridUnesp
- COVID-19
- Contato