.. _Partitioninder:

PartitionFinder
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De acordo com a `página do PartitionFinder <http://www.robertlanfear.com/partitionfinder/>`_,
"PartitionFinder is free open source software to select best-fit partitioning
schemes and models of molecular evolution for phylogenetic analyses".


Versões Disponíveis
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* partitionfinder/2.1.1


Submissão de Jobs Seriais
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Crie um arquivo chamado, por exemplo, *submit_serial_jobs.sh*.

.. code-block:: bash

   #!/bin/bash
   #SBATCH -t 23:00:00

   export INPUT="examples"
   export OUTPUT="*"

   module load partitionfinder/2.1.1
   job-nanny python $PartitionFinder examples/nucleotide

Ao carregar o módulo, estarão disponíveis:

.. code-block:: bash

   $PartitionFinder           = PartitionFinder.py
   $PartitionFinderProtein    = PartitionFinderProtein.py
   $PartitionFinderMorphology = PartitionFinderMorphology.py


Para submeter o processo, basta usar o comando:

.. code-block:: bash

   sbatch submit_serial_jobs.sh


Referências
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Para informações adicionais sobre o software, consulte a `documentação do PartitionFinder <http://www.robertlanfear.com/partitionfinder/tutorial/>`_.