.. _Phyluce:

Phyluce
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De acordo com a `documentação do Phyluce <http://phyluce.readthedocs.io/en/latest/>`_,
"*phyluce (phy-loo-chee) is a software package that was initially developed for
analyzing data collected from ultraconserved elements in organismal genomes*".


Versões Disponíveis
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* phyluce/1.5.0


Submissão de Jobs Seriais
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Crie um arquivo chamado, por exemplo, *submit_serial_jobs.sh*.

.. code-block:: bash

   #!/bin/bash
   #SBATCH -t 7-00 -c 12

   export INPUT="assembly.conf"
   export OUTPUT="*"

   module load phyluce
   job-nanny phyluce_assembly_assemblo_trinity --conf assembly.conf --output trinity-assemblies --clean --cores 12

Para submeter o processo, basta usar o comando:

.. code-block:: bash

   sbatch submit_serial_jobs.sh


Referências
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Para informações adicionais sobre o software, consulte a `documentação do Phyluce <http://phyluce.readthedocs.io/en/latest/>`_.