Suporte (GridUNESP)

h1. Dirac

h2. Envio local, exemplos de scripts

Informações sobre o uso direto do cluster local estão em [[SLURM|aqui]].

h3. Serial

<pre>

#!/bin/bash

#SBATCH -t 5:00

module load dirac

pam --scratch=/tmp --mol=methanol.xyz --inp=hf.inp

</pre>

h3. SMP

<pre>

#!/bin/bash

#SBATCH -t 5:00 -c 4

module load dirac

export OMP_NUM_THREADS=4

pam --dirac=$DIRAC_EXEC_SMP --scratch=/tmp --mol=methanol.xyz --inp=hf.inp

</pre>

h3. MPI

<pre>

#!/bin/bash

#SBATCH -t 5:00 -n 16

module load dirac

pam --dirac=$DIRAC_EXEC_MPI --mpi=16 --scratch=/tmp --mol=methanol.xyz --inp=hf.inp

</pre>

h2. Submissa Simplificada

{{include(SubmissaoSimplificadaCabecalho)}}

Exemplo:

<pre>

APP=dirac

CASE=nome_do_caso

INPUT="cc.inp clf.xyz"

ARGS="--mol=clf.xyz --inp=cc.inp"

PPH=8

</pre>

Caso OUTPUT não seja declarado, o sistema salvará arquivos no formato nome_do_caso.out e nome_do_caso.tgz

*Para rodar em modo serial, omita a linha HOSTS*

É possível alocar diversos processos mpi, usando HOSTS (por exemplo HOSTS=32 e omitindo PPH). Porém isso implicará a utilização de um disco compartilhado, que pode ser mais lento. A opção PPH=8 alocará todos os processos na mesma máquina.

{{include(SubmissaoSimplificadaRodape)}}