Suporte (GridUNESP)

{{include(SubmissaoSimplificadaCabecalho)}}

h1. Gamess

Exemplo:

<pre>

APP=gamess

CASE=caso

HOSTS=4

</pre>

Essa submissão espera o arquivo de entrada "caso.inp". O arquivo .stdout (saída padrão) será atualizado a cada 15 minutos. O arquivo .dat a cada 3 horas.

Parâmetros:

* CASE - Nome do caso. Define o nome de arquivos de entrada, log e saida. *Padrão:* (nome do arquivo de parâmetros, sem a extensão)

* HOSTS - Número de hosts (processos) para a execução. *Padrão:* 1

h2. Reiniciando a simulação

Segue uma sugestão enviada pelo Augusto de como reiniciar a simulação.

Observe que para restart para cálculos de otimização de estrutura, para cálculos vibracionais, por exemplo, mais informações teriam de ser coletadas do arquivo .dat.

1) Obter a última estrutura otimizada:

<pre>

datagam -G case.stdout

</pre>

(um arquivo denominado LAST será escrito com as ultimas coordenadas obtidas na otimização)

2) Obter os últimos grupos de $VEC:

<pre>

datagam -i VEC -1 case.dat

</pre>

(um arquivo VEC.last será criado)

3) Copiar o arquivo case.inp para um case_restart.inp;

4) Substituir a estrutura do arquivo case_restart.inp pela estrutura presente no arquivo LAST;

5) Inserir no fim do arquivo case_restart.inp o arquivo VEC.last

6) Colocar/modificar a linha de comando $GUESS ficando assim 

<pre>

(configuração mínima):

      $GUESS GUESS=MOREAD $END

</pre>

{{include(SubmissaoSimplificadaRodape)}}