Suporte (GridUNESP)

h1. Gamit

*Recomenda-se fortemente o uso do envio local. Desse modo, não é mais necessário gerar um .zip e o arquivo commands.sh*

h2. Envio local, exemplos de scripts

Informações sobre o uso direto do cluster local estão em [[SLURM|aqui]].

<pre>

#!/bin/bash

#SBATCH -t 30:00

module load gamit

# Cria um link no $HOME para a versão atual do Gamit

if [ ! -e ~/gg ]

then

  ln -s /opt/GridUNESP/gamit/current ~/gg

fi

# setup env

sh_setup -yr 2000

sed -i "s/itrf05.apr/regional.apr/" tables/process.defaults

# Configura o seu email

sed -i "s/set mailto = ''/set mailto = 'mail@example.org'/" tables/process.defaults

cd tables

sh_upd_stnfo -l sd

mv station.info.new station.info

sh_upd_stnfo -files ../rinex/*.00o

cd ..

# run gamit

sh_gamit -expt scal -d 2000 034 035 036 -pres ELEV -orbit IGSF -copt x k p -dopts c ao

sh_glred -s 2000 034 2000 036 -expt scal -opt H G E

</pre>

h2. Submissa Simplificada

{{include(SubmissaoSimplificadaCabecalho)}}

Por sua complexidade, é necessário preparar os arquivos de entrada do Gamit e empacotá-los em um ou mais .zip.

Também é necessário criar um arquivo nomeado "commands.sh".

Exemplo .go:

<pre>

APP=gamit

INPUT="2000.zip commands.sh"

OUTPUT="output.zip"

</pre>

Exemplo commands.sh:

<pre>

# setup env

sh_setup -yr 2000

sed -i "s/itrf05.apr/regional.apr/" tables/process.defaults

sed -i "s/set mailto = ''/set mailto = '$USER@grid.unesp.br'/" tables/process.defaults

cd tables

sh_upd_stnfo -l sd

mv station.info.new station.info

sh_upd_stnfo -files ../rinex/*.00o

cd ..

# run gamit

sh_gamit -expt scal -d 2000 034 035 036 -pres ELEV -orbit IGSF -copt x k p -dopts c ao

sh_glred -s 2000 034 2000 036 -expt scal -opt H G E

# pack output

zip -ry output.zip *

exit 0

</pre>

Um exemplo do arquivo 2000.zip está disponível em /opt/GridUNESP/gamit/tests/2000.zip

{{include(SubmissaoSimplificadaRodape)}}