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Gabriel Winckler, 09 Feb 2012 16:33

1 1 Gabriel Winckler
{{include(SubmissaoSimplificadaCabecalho)}}
2 1 Gabriel Winckler
3 1 Gabriel Winckler
h1. RAxML
4 1 Gabriel Winckler
5 1 Gabriel Winckler
Exemplo:
6 1 Gabriel Winckler
<pre>
7 1 Gabriel Winckler
APP=raxml
8 1 Gabriel Winckler
CASE=node_do_caso
9 1 Gabriel Winckler
HOSTS=4
10 1 Gabriel Winckler
QUEUE=short
11 1 Gabriel Winckler
</pre>
12 1 Gabriel Winckler
13 1 Gabriel Winckler
Caso INPUT não seja declarado, o sistema utilizará nome_do_caso.phy.
14 1 Gabriel Winckler
15 1 Gabriel Winckler
Caso OUTPUT não seja declarado, o sistema utilizará *nome_do_caso*.
16 1 Gabriel Winckler
17 1 Gabriel Winckler
Parâmetros:
18 1 Gabriel Winckler
* CASE - Nome do caso. Define o nome de arquivos de entrada, log e saida. *Padrão:* (nome do arquivo de parâmetros, sem a extensão)
19 1 Gabriel Winckler
* HOSTS - Número de hosts (processos) para a execução. *Padrão:* 1
20 1 Gabriel Winckler
* PPH - Número de cores por servidor. Ativa o modo multi-thread. *Padrão:* 1
21 1 Gabriel Winckler
22 1 Gabriel Winckler
*OBS: Alguns testes indicam problemas na execução misturando os modos MPI (HOSTS=) e SMP (PPH=).*
23 1 Gabriel Winckler
24 1 Gabriel Winckler
{{include(SubmissaoSimplificadaRodape)}}