Charmm » History » Version 2
Version 1 (Gabriel Winckler, 26 Aug 2015 17:11) → Version 2/3 (Gabriel Winckler, 26 Aug 2015 18:18)
h1. Charmm
*Por uma restrição da licença desse programa, é necessária uma permissão especial para utilizá-lo. Envie um email para support@ncc.unesp.br para solicitar esse acesso.*
h2. Envio local, exemplos de scripts
Informações sobre o uso direto do cluster local estão em [[SLURM|aqui]].
h3. MPI
<pre>
#!/bin/bash
#SBATCH -t 3:00 -n 16
module load charmm
goo-job-nanny srun -n16 charmm < input.inp
</pre>
h3. Serial
<pre>
#!/bin/bash
#SBATCH -t 3:00
module load charmm/c37b2-serial
goo-job-nanny charmm < input.inp
</pre>
*Por uma restrição da licença desse programa, é necessária uma permissão especial para utilizá-lo. Envie um email para support@ncc.unesp.br para solicitar esse acesso.*
h2. Envio local, exemplos de scripts
Informações sobre o uso direto do cluster local estão em [[SLURM|aqui]].
h3. MPI
<pre>
#!/bin/bash
#SBATCH -t 3:00 -n 16
module load charmm
goo-job-nanny srun -n16 charmm < input.inp
</pre>
h3. Serial
<pre>
#!/bin/bash
#SBATCH -t 3:00
module load charmm/c37b2-serial
goo-job-nanny charmm < input.inp
</pre>