Charmm » History » Version 3

Gabriel Winckler, 26 Aug 2015 18:19

1 1 Gabriel Winckler
h1. Charmm
2 1 Gabriel Winckler
3 3 Gabriel Winckler
*Por uma restrição da licença desse programa, é necessária uma permissão especial para utilizá-lo. Envie um email para support [at] ncc.unesp.br para solicitar esse acesso.*
4 2 Gabriel Winckler
5 1 Gabriel Winckler
h2. Envio local, exemplos de scripts
6 1 Gabriel Winckler
7 1 Gabriel Winckler
Informações sobre o uso direto do cluster local estão em [[SLURM|aqui]].
8 1 Gabriel Winckler
9 1 Gabriel Winckler
h3. MPI
10 1 Gabriel Winckler
11 1 Gabriel Winckler
<pre>
12 1 Gabriel Winckler
#!/bin/bash
13 1 Gabriel Winckler
#SBATCH -t 3:00 -n 16
14 1 Gabriel Winckler
15 1 Gabriel Winckler
module load charmm
16 1 Gabriel Winckler
goo-job-nanny srun -n16 charmm < input.inp
17 1 Gabriel Winckler
</pre>
18 1 Gabriel Winckler
19 1 Gabriel Winckler
20 1 Gabriel Winckler
h3. Serial
21 1 Gabriel Winckler
22 1 Gabriel Winckler
<pre>
23 1 Gabriel Winckler
#!/bin/bash
24 1 Gabriel Winckler
#SBATCH -t 3:00
25 1 Gabriel Winckler
26 1 Gabriel Winckler
module load charmm/c37b2-serial
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goo-job-nanny charmm < input.inp
28 1 Gabriel Winckler
</pre>