Suporte (GridUNESP)

h1. Garli

h2. Envio local, exemplos de scripts

Informações sobre o uso direto do cluster local estão em [[SLURM|aqui]].

h3. Serial

<pre>

#!/bin/bash

#SBATCH -t 5:00

module load garli

goo-job-nanny Garli 

</pre>

h3. MPI

<pre>

#!/bin/bash

#SBATCH -t 5:00 -n 16

module load garli

goo-job-nanny mpirun -np 16 Garli.mpi -b garli-mpi.conf

</pre>

h2. Submissa Simplificada

{{include(SubmissaoSimplificadaCabecalho)}}

Exemplo serial:

<pre>

APP="garli"

INPUT="garli.conf rana.nex"

OUTPUT="rana.nuc*"

QUEUE=short

</pre>

Exemplo paralelo:

<pre>

APP="garli"

CASE="garli-mpi"

INPUT="$CASE.conf $CASE.nex"

ARGS="$CASE.conf"

HOSTS=4

QUEUE=short

</pre>

É mandatório especificar os arquivos de entrada (INPUT) e saída (OUTPUT).

Caso o arquivo de entrada não seja garli.conf, é necessário especificar em ARGS.

*Para rodar em modo serial, omita a linha HOSTS*

{{include(SubmissaoSimplificadaRodape)}}