Suporte (GridUNESP)

h1. Projetos Cadastrados

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h2. Biologia

h2. Biofísica

h2. Ciência da Computação

h3. Detecção de Eventos por Mineração de Dados Paralelizada em Fluxos de Rede IPFIX

*Descrição do Projeto*

Este projeto apresenta a proposta de desenvolvimento e consolidação de um sistema de detecção e correlação de eventos relacionados à segurança de redes de computadores. O sistema, já prototipado por nossa equipe e em produção, possui como estrutura de base a utilização do protocolo IPFIX (IP Flow Information Export) como exportador de informações sumarizadas de uma rede de computadores. O projeto prevê quatro núcleos principais: 1.) O desenvolvimento de um protocolo baseado no processo de !NetFlow (formalizado pela IETF - Internet Engineering Task Force como sendo o protocolo IPFIX no RFC-5101) e que acrescente melhorias na sumarização das informações prestadas, consumindo menor espaço de armazenamento; 2.) A implementação de um modelo de armazenamento do novo protocolo em um banco de dados distribuído; 3.) A utilização de prospecção de dados, tais como técnicas de mineração de dados associativas, classificatórias, previsivas ou de agrupamento para detecção, correlação, classificação; e 4.) Previsão de eventos de segurança em redes de computadores. A arquitetura do sistema é baseada em clusters que visam paralelizar tarefas tanto para o armazenamento dos dados quanto para sua prospecção, objetivando maximizar o desempenho computacional. Este modelo de sistema mostra-se pioneiro na análise através da mineração de fluxos de dados, empreendendo características importantes aos sistemas de segurança computacional, tais como a escalabilidade no monitoramento de infra-estruturas de redes de alta velocidade, detecção rápida de tentativas de atividades ilícitas (tais como a propagação de worms ou estabelecimento de botnets), detecção ou previsão de ataques de negativa de serviço (!DoS), entre outros considerados as maiores ameaças atuais na Internet. Como subproduto é importante citar que este sistema pode ser usado para fornecer proteção à própria estrutura do !GridUNESP, uma vez que sensores podem ser implantados em elementos estratégicos da grade, de tal forma a coletar e analisar os seus dados de fluxos, permitindo a detecção rápida de eventos e a adoção de contramedidas. 

*Grupo de Pesquisa*

| Nome | Instituição |

| "Adriano Mauro Cansian (Coordenador)":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4728008Z9 | IBILCE |

| "Adriano César Ribeiro":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4214965Z3 | IBILCE |

| "André Proto":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4231782D1 | IBILCE |

| "Luiz Heitor Waiteman":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4482985T7 | IBILCE |

| "Isabela Liane de Oliveira":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4254467D6 | IBILCE |

| "Jorge Luiz Corrêa":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4137999H6 | IBILCE |

| "Leandro Arabi Alexandre":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4250579A1 | IBILCE |

| "Maira Lambort Batista":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4279800A2 | IBILCE |

h3. Implementação e Otimização de Algoritmos de Alinhamentos Múltiplos de Sequências em Ambientes “Grid”

*Descrição do Projeto*

A solução de problemas genômicos propostos pelos biólogos, tornou-se inviável sem o uso de ferramentas computacionais, o que desenvolveu, de maneira intensa, o campo da Bioinformática, aproximando cientistas da computação e biólogos. Inicialmente, era possível resolver os problemas de Bioinformática através do uso de máquinas sequenciais, pois apenas uma pequena parcela dos problemas genômicos era tratada, conhecida e explorada pelos biológos. A evolução da complexidade desses problemas fez com que o uso de computação sequencial não fosse mais suficiente para resolvê-los, criando um uso massivo da computação paralela na criação das novas ferramentas e algoritmos em Bioinformática. A partir disso, adotou-se a idéia da resolução de grandes problemas, através de sua execução em máquinas paralelas de vários portes. No entanto, isso possui duas vertentes, uma delas compromete a execução caso a máquina paralela não seja suficientemente poderosa para tratar o problema. Por outro lado, quando a máquina é poderosa o suficiente, em geral, está acessível para uma pequena parcela de pesquisadores e o custo para a sua construção é elevado. Assim, o presente projeto propõe a idéia de implementação de algoritmos de alinhamento múltiplo de biossequências em “Grids”, para aumentar significativamente a capacidade de processamento e armazenamento na resolução desses problemas, explorando custo financeiro menor do “Grid”, visto que ele pode ser composto de equipamentos heterogêneos e distribuído por uma rede de comunicação utilizada mundialmente, que é a internet. 

*Grupo de Pesquisa*

| Nome | Instituição |

| "José Márcio Machado (Coordenador)":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4781876T1 | Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas |

| "Geraldo Francisco Donegá Zafalon":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4138050E6 | Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas |

| "Liria Matsumoto Sato":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4787468P8 | Poli - USP |

| "Angelo Passaro":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4789419P8 | IEAv - CTA |

| "Mario Luiz Tronco":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4723039H1 | Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas |

h3. Métodos Analíticos e Numéricos em Mecânica Computacional

*Descrição do Projeto*

Mecânica computacional é a disciplina relacionada com o uso de métodos computacionais para estudar fenômenos governados pelos princípios da mecânica.

A mecânica computacional (CM – computational mechanics) é interdisciplinar. Seus três pilares são: matemática, ciência computacional e mecânica. Dinâmica de fluidos computacional, termodinâmica computacional, eletromagnetismo computacional e mecânica dos sólidos computacional são algumas das muitas especializações existentes.

A matemática leva à modelagem de fenômenos físicos dos processos encontrados na mecânica, em termos de equações, geralmente, diferenciais parciais, muitas vezes, não lineares. Na ciência computacional, códigos computacionais são desenvolvidos para resolver as equações diferenciais parciais por alguma técnica computacional: analítica e/ou numérica. Na maioria dos casos, devido às complexidades das equações e das geometrias, técnicas numéricas tais como método de diferenças finitas e métodos de elementos finitos são empregadas para se obter simulações dos processos a serem estudados.

O uso de técnicas numéricas, em geral, permite transformar sistemas de equações diferencias parciais em grandes sistemas algébricos, os quais requerem para rápida solução o uso de recursos computacionais de elevada capacidade de processamento. Isto remete ao uso de processamento paralelo para redução dos tempos computacionais.

Neste projeto, estão envolvidos pesquisadores das áreas de Engenharia Mecânica, Engenharia Civil, Física e Matemática. Os problemas envolvem simulações de processos fluido-térmicos, problemas em mecânica dos sólidos, ciências dos materiais e matemática aplicada. Os problemas não requerem tanta capacidade de armazenamento como na física de altas energias, mas requerem, por exemplo, como no caso de simulações em dinâmica dos fluidos computacional para escoamentos turbulentos, grande capacidade de processamento. Problemas de interação fluido estrutura, que podem existir tanto em engenharia mecânica ou civil, são também casos que requerem alta capacidade de processamento.

Até o presente momento, o grupo tem usado recursos computacionais limitados, obviamente, limitando o tamanho e complexidade dos problemas que poderiam ser analisados. Desta forma, o uso dos recursos computacionais do GridUnesp possibilitará abordar problemas muito maiores do que os que têm sido estudados e obter respostas dentro de tempos inferiores aos atualmente praticados. Isto possibilitará avanços nas pesquisas que vem sendo realizadas as quais estavam limitadas pelos recursos computacionais de que se dispunham. 

*Grupo de Pesquisa*

| Nome | Instituição |

| "João Batista Aparecido (Coordenador)":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4787768P0 | Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira |

| "Amarildo Tabone Paschoalini":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4709059Y7 | Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira |

| "André Luiz Seixlack":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4788847Y6 | Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira |

| "Antonio João Diniz":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4797405Y2 | Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira |

| "Aristeu da Silveira Neto":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4781876D5 | Universidade Federal de Uberlândia |

| "Cassio Roberto Macedo Maia":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4789830A8 | Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira |

| "Edison Righetto":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4727659U1 | Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira |

| "Edson Del Rio Vieira":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4765019Y4 | Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira |

| "Emanuel Rocha Woiski":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4787963Y3 | Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira |

| "Haroldo de Mayo Bernardes":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4706330H4 | Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira |

| "Homero Ghioti da Silva":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4766622A4 | Universidade Federal de Uberlândia |

| "João Antonio Pereira":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4783818Z4 | Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira |

| "João Batista Campos Silva":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4785884Z2 | Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira |

| "José Luiz Gasche":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4798091D8 | Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira |

| "Luiz Carlos Facundo Sanches":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4795529Y2 | Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira |

| "Luiz Felipe Mendes de Moura":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4780080J3 | Unicamp |

| "Marco Donisete de Campos":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4767274Z9 | Universidade Federal de Mato Grosso |

| "Mônica Pinto Barbosa":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4781113D4 | Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira |

| "Odacir Almeida Neves":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4778842U6 | Universidade Federal Rural do Semi-Árido |

| "Ricardo Alan Verdú Ramos":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4701433Y1 | Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira |

| "Sérgio Said Mansur":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4787218H2 | Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira |

| "Vanessa Davanço Pereira":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4757778Y6 | Faculdades de Campinas |

h2. Ciência dos Materiais

---+++Dinâmica de Vórtices em Supercondutores

*Descrição do Projeto*

O estudo do comportamento dinâmico de redes de vórtices em supercondutores do tipo II tem sido objeto de estudo tanto do ponto de vista teórico como experimental. Quando a rede é colocada em movimento pela aplicação de uma corrente de transporte numa amostra com centros de pinning que podem aprisionar os vórtices, o movimento fica complexo e uma solução analítica do problema não é possível. A corrente máxima que um supercondutor pode suportar antes de termos dissipação, é chamada de densidade de corrente crítica. Um dos objetivos em supercondutores de alta temperatura crítica (HTSC) é aumentar essa corrente crítica, para que o uso em aplicações praticas seja viável. O pinning de vórtices é o mecanismo usualmente utilizado para aumentar a corrente crítica. Tem havido consideráveis esforços para melhorar os mecanismos de pinning em HTSC. Isso pode ser feito criando defeitos estruturais através de diversos tratamentos das amostras, especialmente usando radiações energéticas. Usando litografia é possível criar arranjos periódicos nanoestruturados e bem definidos de centros de pinning, nos quais parâmetros tais como tamanho, profundidade, periodicidade e densidade, podem ser precisamente controlados. O aumento da corrente crítica em HTSC, usando arranjos periódicos tem sido estudada recentemente teórica e experimentalmente. O estudo dos mecanismos de pinning são importantes para a elaboração de supercondutores mais eficientes. Quando J excede o valor crítico Jc os vórtices entram em movimento, dissipam energia e diversos tipos de movimento podem acontecer, dependendo do arranjo particular de pinnings. No presente trabalho, usando a técnica de Dinâmica Molecular, caracterizamos as diversas fases dinâmicas e analizamos a resistência diferencial para vários arranjos periódicos de pinning, incluindo redes quadradas, hexagonais e outras configurações obtidas a partir da remoção simétrica e aleatória de centros de pinning. Os cálculos serão realizados para filmes de supercondutores do tipo II, usando um campo magnético aplicado menor ou igual que o primeiro campo de encendido e para correntes de transporte transversais e longitudinais. Serão caracterizadas as diversas fases para as redes pinnings propostas e usando os resultados da resistência diferencial, poderemos determinar com precissão as correntes de encendido para cada transição dinâmica. 

*Grupo de Pesquisa*

| Nome | Instituição |

| "Pablo Venegas (Coordenador)":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?metodo=apresentar&id=K4783997A5 | Faculdade de Ciências de Bauru |

---+++Estrutura Eletrônica de Materiais

*Descrição do Projeto*

A estrutura eletrônica de materiais é uma área de investigação teórica onde se aplica a Mecânica Quântica para descrever a distribuição espacial e os níveis de energia dos elétrons que compõem o sistema em estudo, que pode variar em tamanho desde a mais simples molécula diatômica até sólidos extensos com mais de 1023 átomos. Os resultados dos cálculos de estrutura eletrônica podem ser aplicados para a previsão e explanação dos mais diversos tipos de dados experimentais de natureza quântica que possam ser colhidos dos materiais. Assim, por exemplo, a absorção e emissão de luz, podem ser previstas pela teoria; ou então, em sistemas extensos, a estrutura eletrônica determina as propriedades de condução elétrica do material: se este é um isolante, semicondutor ou condutor de eletricidade. Deste modo, a área de estrutura eletrônica fornece ferramentas adicionais importantes para a melhor compreensão de materiais existentes ou em desenvolvimento. Dada a sua natureza complexa, a área de estrutura eletrônica é quase totalmente desenvolvida com o uso de computadores e isto de certa forma delimita os sistemas que podem ser estudados e estimula a busca e utilização do método de cálculo mais conveniente. A tecnologia de grid com certeza vai permitir que se estude uma gama bem maior de situações e materiais. Existe uma grande variedade de métodos de cálculo. A maioria deles adota a abordagem de orbitais moleculares ou cristalinos, desde aproximações semi-empíricas muito simples até sofisticados métodos de primeiros princípios (ab initio). Os sistemas de interesse para este projeto são complexos supramoleculares de precursores de materiais óxidos avançados, semicondutores inorgânicos, polímeros condutores, biopolímeros e moléculas de interesse biológico. Através de cálculos no nível de teoria ab initio procuraremos determinar desde a estrutura mais estável para os compostos em estudo, até a simulação de espectros experimentais, que permitam uma comparação com os dados existentes.

*Grupo de Pesquisa*

|"Francisco Carlos Lavarda (Coordenador)":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4782181J8 | Faculdade de Ciências de Bauru |

| "Augusto Batagin Neto":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4756679U5 | Programa de Pós-Graduação em Ciência e Tecnologia de Materiais |

| "Rodrigo Marques Ferreira":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4488845E6 | Faculdade de Ciências de Bauru |

| "Leonardo De Conti Dias Aguiar":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4258657P9 | Faculdade de Ciências de Bauru |

---+++Estudo dos Processos de Fotodissociação e Reatividade do Polímero Orgânico Conjugado Meh-ppv em Solução sob Radiação Ionizante 

*Descrição do Projeto*

Os polímeros orgânicos conjugados têm sido amplamente utilizados em diversos campos tecnológicos devido às suas características semicondutoras e ópticas. Recentemente foi relatada a possibilidade de sua utilização na área de dosimetria. O polímero orgânico poli [2-metóxi,5-(2’etil-hexiloxi)-p-fenilenovinileno] (MEH-PPV), quando diluído em solventes que contenham halogênios, tem apresentado características bastante promissoras nesta área.

Há evidências de que o polímero é alterado pela substituição de átomos de halogênios, provavelmente advindos da fotodissociação das moléculas do solvente, contudo os mecanismos envolvidos ainda não são bem conhecidos.

A compreensão dos processos de dissociação, tanto das moléculas do solvente, como de fragmentos do polímero, bem como a identificação dos sítios de maior reatividade na cadeia polimérica, são fatores de fundamental importância para o entendimento do mecanismo básico de ação que permite este material ser muito promissor na confecção de dosímetros de radiação.

No presente projeto pretende-se realizar cálculos de estrutura eletrônica visando à elucidação dos processos fotoquímicos observados em soluções do MEH-PPV sob radiação ionizante, bem como promover uma melhor compreensão dos mecanismos de ataque de radicais e de alteração estrutural sofrida pela cadeia polimérica em diferentes solventes.

Este projeto visa o aprofundamento de trabalhos anteriores, procurando analisar se a incorporação de radicais sobre a cadeia polimérica é a responsável principal pela alteração cromática do sistema e como estas reações ocorrem. Para tanto pretende-se analisar os processos de fotodissociação das moléculas de solvente, os caminhos de reação que permitem uma possível incorporação de radicais em fragmentos do polímero, e a localização de sítios de maior reatividade sobre a cadeia.

Os cálculos de estrutura eletrônica serão realizados a partir de métodos bem estabelecidos: semiempíricos, ab initio e/ou híbridos mecânicos-quânticos a partir dos quais serão obtidos os resultados teóricos.

*Grupo de Pesquisa*

| "Carlos Frederico de Oliveira Graeff (Coordenador)":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4723273P6 | Faculdade de Ciências de Bauru |

| "Erika Soares Bronze-Uhle":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4765789E8 | Faculdade de Ciências de Bauru |

---+++Estudo Numérico de Sistemas de Elétrons Fortemente Correlacionados em Baixa Dimensionalidade

*Descrição do Projeto*

Na pesquisa em física o estudo de modelos eletrônicos e de spins na rede é uma frente ampla e fecunda. Com modelos relativamente simples é possível capturar as principais características de diversos fenômenos, e muitas áreas de pesquisa se beneficiam dessa abordagem. Neste projeto estamos interessados em modelos de elétrons fortemente correlacionados em redes de baixa dimensionalidade. Um exemplo emblemático é o modelo de Hubbard[1], que acredita-se contenha os ingredientes básicos para descrever as propriedades eletrônicas do supercondutores cerâmicos de alta temperatura crítica[2,3]. A característica distintiva dessa categoria de modelos é que as fortes correlações (interações) entre os elétrons tornam tratamentos tipo campo médio (e.g., Hartree-Fock) ou perturbativos ineficazes, exigindo métodos alternativos. Embora vários desses modelos admitam solução analítica, muitos casos de interesse permanecem insolúveis pelos métodos analíticos atualmente disponíveis. Uma alternativa é o uso de computadores. Dentre as várias técnicas computacionais disponíveis queremos destacar aqui a chamada diagonalização numérica. Esse enfoque vem ganhando espaço na literatura devido ao rápido aumento na capacidade de processamento dos computadores e ao surgimento de novas técnicas numéricas assim como o aperfeiçoamento das tradicionais. Nesse tipo de abordagem o espectro de energias e as funções de correlação do modelo são obtidos através da resolução numérica exata da equação de Schrödinger independente do tempo para um sólido contendo tipicamente algumas dezenas de átomos numa rede de baixa dimensionalidade (uma ou duas dimensões espaciais). Como as propriedades físicas de interesse derivam dessas quantidades, uma vez calculadas elas permitem estabelecer o comportamento do modelo, o qual é então analisado no contexto da particular fenomenologia que o motivou. Em seguida, essas informações são expressas na forma de diagramas de fases, permitindo uma visão unificada dos resultados.

Do ponto de vista puramente operacional resolver a equação de Schrödinger significa resolver um problema de auto-valores e auto-vetores para uma matriz (a Hamiltoniana do modelo) cuja dimensão cresce exponencialmente com o número de graus de liberdade (número de átomos na rede) envolvidos. Para que resultados significativos sejam obtidos o número de átomos que precisa ser utilizado torna o problema extremamente difícil de ser resolvido. Isso justifica o uso de técnicas específicas tais como o método de Lanczos[4] e os algoritmos do grupo de renormalização da matriz densidade (DMRG)[5]. Essa técnicas fornecem o espectro de energias as funções de onda do modelo, sendo que essas últimas permitem o cálculo das diversas funções de correlação. 

*Grupo de Pesquisa*

| "André Luiz Malvezzi (Coordenador)":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4782535T5 | Faculdade de Ciências |

| "Márcio José Martins":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4787103H4 | UFSCar |

| "Raimundo Rocha dos Santos":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4787959P5 | UFRJ |

| "Thereza Cristina de Lacerda Paiva":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4784685P0 | UFRJ |

| "Edson Sardella":http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781724Y6 | Faculdade de Ciências |

h2. Física

h2. Geociências

h2. Meteorologia

h2. Química