Amber

De acordo com a página do Amber, “The Amber20 package builds on AmberTools21 by adding the pmemd program, which resembles the sander (molecular dynamics) code in AmberTools, but provides (much) better performance on multiple CPUs, and dramatic speed improvements on GPUs”.

Versões Disponíveis

amber/20

Submissão de Jobs Seriais

Crie um arquivo chamado, por exemplo, submit_serial_jobs.sh.

#!/bin/bash
#SBATCH -t 23:00:00

export INPUT="tleap.in"
export OUTPUT="*"

module load amber/20
job-nanny tleap -f tleap.in

Para submeter o processo, basta usar o comando:

sbatch submit_serial_jobs.sh

Referências

Para informações adicionais sobre o software, consulte a documentação do Amber.