Phyluce

De acordo com a documentação do Phyluce, “phyluce (phy-loo-chee) is a software package that was initially developed for analyzing data collected from ultraconserved elements in organismal genomes”.

Versões Disponíveis

phyluce/1.5.0

Submissão de Jobs Seriais

Crie um arquivo chamado, por exemplo, submit_serial_jobs.sh.

#!/bin/bash
#SBATCH -t 7-00 -c 12

export INPUT="assembly.conf"
export OUTPUT="*"

module load phyluce
job-nanny phyluce_assembly_assemblo_trinity --conf assembly.conf --output trinity-assemblies --clean --cores 12

Para submeter o processo, basta usar o comando:

sbatch submit_serial_jobs.sh

Referências

Para informações adicionais sobre o software, consulte a documentação do Phyluce.