PartitionFinder

De acordo com a página do PartitionFinder, “PartitionFinder is free open source software to select best-fit partitioning schemes and models of molecular evolution for phylogenetic analyses”.

Versões Disponíveis

• partitionfinder/2.1.1

Submissão de Jobs Seriais

Crie um arquivo chamado, por exemplo, submit_serial_jobs.sh.

#!/bin/bash
#SBATCH -t 23:00:00

export INPUT="examples"
export OUTPUT="*"

module load partitionfinder/2.1.1
job-nanny python $PartitionFinder examples/nucleotide

Ao carregar o módulo, estarão disponíveis:

$PartitionFinder           = PartitionFinder.py
$PartitionFinderProtein    = PartitionFinderProtein.py
$PartitionFinderMorphology = PartitionFinderMorphology.py

Para submeter o processo, basta usar o comando:

sbatch submit_serial_jobs.sh

Referências

Para informações adicionais sobre o software, consulte a documentação do PartitionFinder.