Aplicações instaladas
Para facilitar a utilização dos recursos computacionais do GridUnesp, diversas aplicações científicas já foram instaladas pela equipe técnica, podendo dispor de mais de uma versão de algumas aplicações.
Caso o usuário não encontre a aplicação que deseje pré-instalada, ele pode fazer a
instalação no diretório pessoal (/home/
) conforme explicado na Seção
Instalando Aplicações, ou solicitar que a equipe técnica
efetue a instalação no sistema enviando e-mail para support.ncc@unesp.br
.
Para verificar a lista das aplicações instaladas e versões correspondentes, basta usar o comando
module avail
Caso o usuário queira carregar o ambiente de algum dos módulos, gcc/10.2.0 por exemplo, o comando a ser dado é
module load gcc/10.2.0
Para saber mais sobre os módulos, a Seção Instalação feita pelo administrador do sistema apresenta mais informações.
Atenção
Por estar obsoleto, o servidor access.grid.unesp.br foi permanentemente desligado. Portanto, agora o login no GridUnesp é feito apenas através do servidor access2.grid.unesp.br segundo explicado em Acessando o Cluster.
Dessa forma, as aplicações listadas abaixo estão todas disponíveis no servidor access2.
Com o desligamento do servidor access, é possível que os programas lá
instalados não funcionem como o esperado já que as versões de binários e
bibliotecas instaladas na raiz do sistema dos dois servidores podem ser diferentes.
Em caso de dificuldades, o usuário pode enviar mensagem para a lista de
suporte (support.ncc@unesp.br
).
- Bibliotecas, compiladores e linguagens
- Amber
- Anaconda
- Beast
- Bowtie2
- Charmm
- ClustalW
- CP2K
- Crystal
- DFTB+
- Dirac
- ESPResSo
- ExaBayes
- Exciting
- fastStructure
- Foam-Extend
- g_mmpbsa
- Gamess
- Gamit
- Gaussian
- Gromacs
- Hmmer
- Lammps
- Mathematica
- Mopac
- Namd
- NetCDF
- OpenFoam
- Orca
- PartitionFinder
- PFinderUCE-SWSC-EN
- Phyluce
- Quantum-Espresso
- quest-qmc
- R
- RAxML
- RAxML-NG
- RNXCMP
- ROOT - Data Analisys Techniques
- RSEM
- Salmon
- Siesta
- Stacks
- Structure
- SU2
- SWAN
- Tesseract
- Trinity
- Weka